Inhalt

• DateitypKomprimierte Ausrichtungsdatei
• Binär
• Was ist eine CRAM-Datei?
• Über CRAM-Dateien

DateitypKomprimierte Ausrichtungsdatei

Entwickler	EBI
Popularität	3,0 (1 Stimme)
Kategorie	Datei
Format	Binäres X Binär Diese Datei wird in einem binären Format gespeichert, das ein bestimmtes Programm zum Lesen des Inhalts erfordert.

Was ist eine CRAM-Datei?

Format für komprimierte Ausrichtungsdateien, entwickelt von EBI, einer Außenstation des Europäischen Labors für Molekularbiologie; speichert kurze DNA-Sequenz-Read-Alignments, die von Short-Read-Alignern wie BWA, BBMap und BLAT erstellt wurden. Mehr Informationen

Das CRAM-Dateiformat ähnelt dem BAM-Dateiformat (Binary Alignment / Map), bietet jedoch eine bessere Dateikomprimierung und ein umstrukturiertes spaltenorientiertes binäres Containerformat. Da das Datenvolumen im Bereich der genetischen Software zunimmt, wurde das CRAM-Format entwickelt, um den Speicherbedarf der Ausrichtungsdaten zu verringern.

Short Read Alignment ist der Prozess der Entschlüsselung, woher eine Sequenz im Genom kommt. Dies kann schwierig sein, da das Referenzgenom ziemlich groß ist und Sie nicht immer nach genauen Übereinstimmungen im Referenzgenom suchen. Short Read Aligners werden verwendet, um riesige Sequenzen nach Übereinstimmungen und Übereinstimmungen zu durchsuchen. Da die Sequenzen so groß sind, ist eine Komprimierung durch Formate wie CRAM erforderlich, um die Dateigrößen überschaubar zu halten.

KOSTENLOSER DOWNLOAD Laden Sie den Datei-Viewer für Android-Programme herunter, die CRAM-Dateien öffnen

Windows

Samtools

Aktualisiert am 11.01.2016

Über CRAM-Dateien

Unser Ziel ist es, Ihnen zu zeigen, was eine Datei mit dem Suffix * .cram ist und wie Sie sie öffnen.

Der Dateityp "Komprimierte Ausrichtung", die Beschreibung des Dateiformats und die auf dieser Seite aufgeführten Windows-Programme wurden vom FileInfo-Team einzeln recherchiert und überprüft. Wir bemühen uns um 100% ige Genauigkeit und veröffentlichen nur Informationen über Dateiformate, die wir getestet und validiert haben.

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